La biodiversité est garante d'une agriculture propre et d'un large choix d'aliments locaux, goûteux, nutritifs. L’association valorise, dans sa revue Fruits Oubliés, cette biodiversité et les acteurs de son retour dans l'alimentation. Elle participe aussi à la mise en lien des initiatives en France ainsi qu'au plaidoyer auprès des institutions pour améliorer la prise en compte de la biodiversité.